本发明提供一种快速检测甲型流感、乙型流感和新型冠状病毒的多重引物及试剂盒，涉及分子生物学检测技术及分子诊断领域。本发明的基于用反转录热对流实时荧光PCR的方法，针对甲型流感病毒、乙型流感病毒和新型冠状病毒各自保守区域开发的特异性多重快速诊断体系，同时还检测人内源基因进行样本质控。该多重引物和试剂盒的特异性好、灵敏度高，还具有简便、快速和实用的特点，满足出入境和现场环境下对甲型流感病毒、乙型流感病毒和新型冠状病毒的检测需要。