本发明公开了一种对虾苗种培育自动投料装置及运行方法，其特征包括设置有中控系统以及依次设置的饵料仓、洗料槽、临时出料槽和培育池，饵料仓带有流量阀，其出口正对洗料槽内设置的网框，洗料槽内设置震荡装置用于洗料，临时出料槽设置有投料管道连接培育池，投料管道上设置有加压泵阀和花洒喷头；本发明的对虾苗种培育池自动投料装置设置洗料槽主要用于对预配制的片状的虾苗饵料进行洗料，相对于现有本发明通过采用超声波震荡器、循环水泵以及机械动作碾压饵料的方式加速、提高洗料效果过程，且通过中控系统的控制和阀门设计使得本发明的自动投料装置可以定时定量的进行投料，节约人力尤其适合在对虾工厂化苗种培育车间进行使用。