本发明公开了一种利用TBM的管棚钻机进行掌子面钻孔的方法，TBM包括主梁及刀盘、管棚钻机及其钻杆，管棚钻机安装在与主梁连接的环形轨道上，当管棚钻机停留在该环形轨道上至少某一个超前探孔位置时，所述刀盘上至少有一个渣孔能与超前探孔位置的方位相对应并允许管棚钻机的钻杆通过，所述方法依次包括以下步骤：依据超前探孔位置确定管棚钻机指向掌子面钻孔方位在轴向上存在阻碍的零部件；排除前述步骤中发现的全部阻碍，通过零部件的径向位移、轴向位移、沿轴线转动或拆除的方式完成阻碍排除；调整管棚钻机的位置使其钻杆轴线与所述钻孔方位对正，安装钻杆，进行钻孔。本发明可降低施工周期，节省施工成本。