本说明书公开一种燃机压气机水洗系统及其控制方法，水洗系统包括：用于容纳清水的第一容器；用于容纳洗涤剂的第二容器；具有第一端和第二端的第一管线，第一端与第一容器相连通，第二端与压气机相连通，第二端上设有朝向压气机内壁以及进气导叶的喷头；第一管线上设有第一排污阀；具有第三端和第四端的第二管线，第三端与第二容器相连通，第四端与第一管线相连通；设于压气机下端的第二排污阀、设于透平下端的第三排污阀、设于尾部烟道下端的第四排污阀；控制部，包括控制按钮，用于控制水洗系统的自动启动以及跳步执行。本说明书所提供的燃机压气机水洗系统及其控制方法，清洗效率高，并且系统出现故障停止工作后，可及时排除故障，继续清洗。