本发明公开了一种与药物敏感相关的特征分子筛选、药敏程度检测、细胞亚型检测的方法，特征分子筛选方法包括如下步骤：步骤一，细胞培养，将细胞与阵列化质谱芯片结合，通过激光解吸/电离质谱检测质谱信号；步骤二，计算各个药物浓度下细胞的脂质对峰强度相对非用药组的变化程度Rr；步骤三，将Rr值与细胞的存活率相对应进行相关性分析；药敏程度检测的方法在特征分子筛选的基础上用Rr判断细胞药物敏感性，细胞亚型检测的方法在检测质谱信号后进行PCA和LDA分析；本发明通过细胞脂质谱进行细胞亚型区分的同时，可以通过质谱对峰判断不同细胞对药物的敏感性，可作为细胞体外药敏分子诊断的替代方案。