本发明属于海上软基处理施工领域，具体公开海上碎石桩船自动供料系统，包括碎石桩船船体、支撑架，安装在支撑架上的振冲处理装置，还包括碎石料仓，安装在碎石桩船船体甲板上用于存储碎石原料；碎石输送装置，用于接收并输送碎石料仓内出来的碎石；过渡料仓，安装在碎石输送装置的输出端用于接收和临时存放输送来的碎石；提升料斗，置于过渡料仓的下方用于接收从过渡料仓出来的碎石；料斗提升装置，驱动提升料斗在垂直方向上下运动并将提升料斗中的碎石输入至振冲处理装置的料仓中。该自动供料系统能够准确的计量碎石的数量，供料过程顺畅不堵塞，操作简单方便，自动化程度高。