本发明公开了一种功能蛋白肽复合纤维及其制备方法，所述制备方法包括以下步骤：将聚合物载体、助剂混合均匀后，在螺杆挤出机内进行共混熔融纺丝，再经拉伸定型，形成第一半成品纤维；将第一半成品纤维浸润在植物提取物溶液中，至一定吸液率后取出并干燥，得第二半成品纤维；将第二半成品纤维浸润在蛋白肽复合溶液中，至一定吸液率后取出并干燥，得所述功能蛋白肽复合纤维。本发明所述的制备方法合理可行，通过该方法制备的功能蛋白肽复合纤维含有功能蛋白肽成分，其具有保湿、抗皱、抗衰老、抗氧化、抑制黑色素形成、改善肤色等多种护肤功效，还添加了植物提取物成分，进一步与蛋白肽成分协同护肤；并且该复合纤维经干燥处理，稳定性好。