本发明公开了一种生物法水力压裂强化煤层瓦斯抽采系统，包括按系统流向依次布置的井下水仓、秸秆浸提池、水箱、高压泵和隔爆电机、压裂管路，井下水仓与秸秆浸提池之间及秸秆浸提池与水箱之间分别设有自吸泵。利用水力压裂将微生物送入高瓦斯煤层，生物质秸秆浸提液为微生物提供营养物质，微生物可以附着于煤的裂隙表面中，以煤中富含侧链含氧官能团有机质为营养物质进行代谢活动，微生物的代谢活动将加快煤层裂隙发育，增加煤层透气性，有效提高煤层瓦斯抽采效率，保障煤矿安全生产。可用于透气性差的高瓦斯煤层。