本申请涉及一种基于频率能量占比的机组机械振动评估方法和系统。该方法包括：构建机组转速变化中机械振动的数据提取方法，从提取的振动数据中获取阶次频率特征参数；根据所述阶次频率特征参数，构建具有空间特征的机组机械振动状态的多元表征矩阵；获取所述机组的健康样本状态矩阵，计算所述健康样本状态矩阵和所述多元表征矩阵的平均欧氏距离，获取期望值；根据所述期望值，评估所述机械振动的频率成分能量结构变化。通过该评估方法不仅实现对机组机械振动状态变化趋势评估，也实现了在机组开机早期发现可能存在的安全隐患，实现开机自检，为机组的安全稳定运行提供指导。此外，该评估方法有效的节省了人工成本并提高了评估效率。