本申请提供了上行数据的同步方法及装置，其中，应用于信关站的方法包括：在检测到存在处于建立阶段的小区的情况下，确定信关站下行时序中的目标索引；在信关站为目标信关站，和/或，小区中存在目标终端的情况下，信关站在信关站下行时序中目标索引指示的时隙的起始时刻之前，向终端下发携带目标信息的消息；目标信息用于指示：小区中的终端在终端的上行时序中目标索引指示的时隙不发送上行数据；在信关站的下行时序中目标索引指示的时隙不调度下行数据。通过本申请可以解决信关站和终端的数据处理难度增大以及加大卫星通信系统的传输时延的问题。