本发明涉及一种基于区块链的联程值机数据处理系统，实现步骤S1、接收联程行程创建指令，获取联程行程id、旅客信息和行程数组，存入联程行程数据结构中；步骤S2、获取行程idm的行程基本信息、验证状态信息和值机状态，存入联程行程数据结构中；步骤S3、判断行程idm的验证状态是否为0，若是，则向第idm节点发送联程行程验证请求，若通过，将验证状态改为1；步骤S4、判断验证状态信息是否全为1，若是，则获取目标共享数据；步骤S5、第idm节点完成值机操作，更新值机状态，将电子凭证存入区块链；步骤S6、判断行程idm对应的值机状态是否全为1，若是，则完成联程值机。本发明提高了联程值机的数据处理效率。