一种DCDC电源控制方法及其控制系统，属于电能变换器技术领域，包括以下步骤：S1：分别采集各并联支路的电流与其主功率器件的工作温度；S2：为各支路分别求得一组模糊控制器的输入量；S3：运用模糊控制器，对各支路分别调用一次模糊控制方法，输出各支路的控制量放大倍数；S4：根据系统给定和反馈，调用闭环控制算法，得到控制输出量；S5：将控制输出量分别与各支路的控制量放大倍数相乘，求得各支路所需的实际控制量；S6：利用实际控制量分别驱动控制对应支路上的主功率器件。该方法能保证各支路上的电流均衡与温度平衡，避免了因电路参数不同而造成的支路电流不均，或是因各支路散热条件的差异而引起的某个支路过热保护的问题。