本申请提出一种污染物观测数据的处理方法、系统、电子设备及存储介质，该方法包括：终端显示绘图展示界面，其包括用于设置绘图方案的接口，绘图方案至少包括方案名称、绘图类型、污染物因子及对应的观测仪器信息；从绘图展示界面中获取用户设置的绘图参数，绘图参数包括观测时间、观测站点信息、数据类型及绘图方案名称；发送绘图参数给服务器，接收服务器返回的绘图参数对应的污染物分析图；将污染物分析图显示在绘图展示界面中。本申请在绘图展示界面中具有用于设置绘图方案的接口，使用户能通过该接口自由组合不同监测仪器观测的污染物因子进行分析，实现污染物观测数据的自定义分析及绘图，满足用户对污染物因子进行多种组合分析的需求。