本发明属于生物技术研究技术领域，具体为一种便携式大量试管培养基灭菌装置及其使用方法，包括盖子、固定环、第一隔板、第二隔板、第一支撑杆、第二支撑杆和底板，所述盖子设置在所述固定换上，所述固定环、第一隔板、第二隔板和底板通过第一支撑杆和第二支撑杆连接，所述第一隔板上开设有第一孔洞，所述第二隔板上开设有第二孔洞；本发明，通过在第一隔板和第二隔板上采用圆形镂空孔洞设计，不仅节约空间，还满足了大量试管的灭菌使用，也能更好地散热，盖子的设计不仅与第一隔板和第二隔板的设计相辅相成，同时也更好的解决了橡胶塞松动脱落带来的诸多麻烦，设置可更换的提手解决了常规方法放置、拿取不便的问题。