本发明属于海洋建筑工程的技术领域，公开了一种高分散有机‑无机复合粉末憎水剂及其制备方法。所述高分散有机‑无机复合粉末憎水剂主要由以下按质量百分数计的组分组成：无机多孔材料45～55％，有机硅烷40～50％，醇类密封剂3～6％，表面活性剂0.5～3％。方法：将无机多孔材料微波辐照，酸处理，在真空环境中，加入有机硅烷、表面活性剂与水搅拌均匀；保持真空环境，加入醇类密封剂搅拌均匀，过滤，干燥，获得所需憎水剂。本发明的憎水剂表观密度为1.8～2.1g/cm3，改善了水泥的憎水性，提高了水泥抗侵蚀能力。改性水泥浆体的接触角为100～135°，氯离子扩散系数0.1～0.3×10‑12m2/s。