本发明公开了一种石墨炉原子吸收法测定硼酸水样中痕量锌和镍的方法，包括步骤：S1确定待测样品中硼酸的浓度，向所述的待测样品中加入硝酸进行酸化，加入的硝酸在所述的待测样品中的含量为0.2~0.5%；S2配制标准溶液；S3待测样品中痕量锌和镍的检测。本发明采用乙醇作为基体改进剂对硼酸水样中的硼酸进行去除，采用石墨炉原子吸收法对痕量锌和镍进行测定；消除了硼酸基体对核电厂一回路水样中锌和镍的含量测定的干扰，避免了硼酸在石墨炉的腔室内的积聚对石墨炉的腐蚀损坏，提高了锌和镍测定的准确性。