本发明公开了一种隧道BIM自动建模方法及系统，包括：在二维设计平台中进行隧道设计，得到二维隧道设计数据；读取二维隧道设计数据，对隧道进行节段划分，得到多个子节段隧道及其对应的衬砌类型；赋予位于隧道交叉口的子节段隧道一个交叉口标记：根据衬砌类型构建子节段隧道对应的隧道三维几何体；对具有交叉口标记的子节段隧道额外创建交叉口布尔剪切体，进行布尔减运算得到隧道交叉口三维几何体；对三维几何体进行封装得到包含隧道交叉口的隧道三维零件；根据所得隧道三维零件在BIM平台中建立隧道三维模型。本发明能够同时适用于无交叉口的隧道和有交叉口的隧道的自动建模，也适用于复杂地下联络通道相互交叉的隧道的自动建模。