本发明公开了一种水性玻璃彩色玉砂材料及其制备方法。本发明的水性玻璃彩色玉砂材料包括A组分和B组分，按质量百分比计，A组分包含如下组分：亲水性脂肪族异氰酸酯为70‑85％、低粘度脂肪族异氰酸酯为10‑20％、异氰酸酯基硅烷偶联剂5‑10％；B组分包含如下组分：羟基树脂分散体30‑50％、环氧树脂分散体5‑10％、硅微粉10‑18％、二氧化硅微球2‑8％、膨润土0.1‑0.5％、助剂1‑10％、色浆、水余量；其中，A组分与B组分的质量比为(1‑3):6。本发明的水性彩色玉砂玻璃材料，综合性能优良，与玻璃表面附着极好，玉砂涂层抗划伤性优良，抗污染易清洁，耐清洗剂擦拭清洁，耐水冲洗冲刷，耐户外气候老化。