本发明提供一种程序烧录方法，应用于主电路板，其中主电路板与多个子电路板连接，主电路板和多个子电路板中的每个均配置有ID号，且主电路板已被烧录安装引导程序，包括：运行主电路板的安装引导程序，以烧录与主电路板中外部接口连接的第一存储介质中存储的内核操作系统；运行内核操作系统，以读取第一存储介质中存储的至少一个ID号和相应的至少一个烧录脚本，其中每个ID号对应一个烧录脚本；在内核操作系统下运行至少一个烧录脚本，以实现根据至少一个ID号将第一存储介质中存储的相应的待烧录程序烧录至主电路板的第二存储介质和/或子电路板。本发明还提供主电路板和子电路板。本发明实现对多个电路板进行程序烧录，简单且有效。