本发明提供一种中速磨煤机动态分离器的调试方法及系统，包括：在中速磨煤机的不同运行参数下采集相应的煤粉粒度平均值，并生成运行参数与煤粉粒度平均值的关系曲线；设定目标煤粉粒度；根据所述目标煤粉粒度和所述关系曲线获取相应的运行参数；将所述相应运行参数设置为所述中速磨煤机的实际运行参数。本发明通过计算各频率下的平均煤粉粒度，得出分离器的频率与煤粉粒度的关系曲线，并将关系曲线导入分散管理系统，指导中速磨煤机的运行，由此准确的获得生产所需粒度的煤粉，提高锅炉效率，并根据振动感应装置感应的分离器振动强度对分离器的异常振动进行报警，避免因分离器的故障造成辅机发生损坏，延长设备使用周期。