本发明公开一种新型的黑臭河水内源治理方法，包括：水体表面悬浮物清理系统、水体底泥污染清除系统和水体水质提升措施。针对河湖水体的内湖污染，分别从水体表面、水底淤泥和水体本身三个层面进行处理。对水体表面悬浮物、藻类、油污等，通过投加浮上型混凝剂将污染物浮上水面，再通过水面捞渣机将表面污染物收集抽送到微纳米气泡气浮设备进行处理，清水返回水体，污染物转移处置。对于水底淤泥，通过底泥洗脱技术进行处理，洗脱底泥中轻质、有机的胶体污染物，消除底泥污染物对水体水质的影响。对于水体，通过投加EM菌和水下森林措施，构建水体生态系统，维持水质的长效达标。