本发明提供了一种磁性树脂分离净化系统及工艺，该系统包括依次连接的原液罐，磁性过滤机，集束式过滤器，树脂收集罐，动态膜过滤系统，所述树脂收集罐连接于集束式过滤器底部的排渣阀，所述动态膜过滤系统的浓液出口与集束式过滤器的进口连接，动态膜过滤系统和磁性过滤机分别接有第一清液罐和第二清液罐。该工艺通过充液、磁性吸附、过滤、浓缩、再过滤、洗涤、干燥等步骤对磁性树脂进行分离净化，除去弱磁性或者磁性消失的树脂，洗涤干燥后的磁性树脂可以循环利用。相比现有技术，利用磁性过滤机对磁性树脂吸附，除去废液中的杂质以及不合格的树脂方便快捷，集束式过滤器的多功能于一体，节省设备、资金投入，占地面积更小。