本发明涉及一种基于网格化水质监测的河道排污口溯源方法，包括以下步骤：将河流划分为多个河段、对每个河段开展网格化水质监测，获取每个河段的监测数据；根据每个河段的监测数据获取每个河段的排污口排放水量，实现污染物排放量的定量核算；根据定量核算结果获取存在污水排放的河段，加密存在污水排放的河段的网格化水质监测，逐步缩小排查范围实现河道排污口溯源。与现有技术相比，本发明解决了排污口污染排放量核算和水下排放等导致的现场排查难度大问题，提供了一种相对便捷化的河道排污口溯源排查手段。