本发明公开了两机一塔配置下循环水运行系统，包括自然通风冷却塔、两台机组配有的四台循环泵、供水管、回水管和两台机组配有的两台凝汽器，所述自然通风冷却塔的内部按照圆周等分为四个扇形区域，每个扇形区域又分为内环和外环共八个区，其中内环与外环淋水面积比为1:1.2，每个所述内环和外环均设置有配水调节挡板，每个配水调节挡板开启高度3米，所述供水管和回水管用于连接循环泵、凝汽器和自然通风冷却塔，从而进行配水调节，所述供水管和回水管上设置有联络阀门，水塔四周设计有10区60组电动挡风帘，用于冬季循环水温度调节。由于采用了两机一塔的设计，本发明的循环泵具有了更加灵活的组合运行方式，实现机组运行经济性的提高。