本发明公开了一种河床底泥生态修复床及其制备方法，所述生态修复床，其特征在于，包括河湖底泥、水泥、粉煤灰、碳源和微生物菌剂；所述制备方法包括以下步骤：S1、将配方量的河床底泥、水泥和粉煤灰混合，在多孔型模具上固结成型，得到多孔型固结体；S2、将步骤S1得到的多孔固结体投入到含有碳源、微生物菌的溶液中浸泡，得到营养固结体；S3、向步骤S2得到的营养固结体中植入水生植物，即得所述河湖底泥生态修复床。本发明施工周期短、施工难度小，净化水质的效率高，适用于河流、湖泊水生态系统构建和水体水质提升，且处理成本低，实现了底泥的资源化利用。