本发明涉及生物工程技术领域，具体涉及5株具有我国自主知识产权的、符合国内传播规律的蜡样芽胞杆菌标准菌株，可用作食品、药品、临床检验等不同领域的标准参考菌株。其保藏号分别为：GDMCC 60865、GDMCC 60866、GDMCC 60867、GDMCC 60868和GDMCC 60869。5株标准菌株具有典型的生理生化特征，且样品来源、遗传背景、耐药性、毒力基因等信息清晰，完全满足食品、药品、临床检验方面对于标准菌株的要求。本发明还涉及一组用于检测、鉴别上述5株标准菌株的特异性靶标基因以及对应的PCR引物。最后，本发明还提供了一种存活率高、特异性的蜡样芽胞杆菌冻干保护剂，可用于本发明标准菌株的长期储存。