本发明公开了一种精密机房空调的双增压泵系统，包括智能控制器、增压泵模组、传感器组件、阀门组件、冷凝器模组和蒸发器模组，所述增压泵模组包括并联的第一增压泵和第二增压泵，所述冷凝器模组包括并联的第一冷凝器模块和第二冷凝器模块，所述阀门组件包括气体输入分配阀、冷量分配阀和气体输出分配阀，所述第一增压泵和第二增压泵分别连接第一冷凝器模块和第二冷凝器模块，且第一增压泵和第二增压泵之间设有稳压储气罐，稳压储气罐连接所述气体输出分配阀，气体输出分配阀分别连接第一冷凝器模块和第二冷凝器模块。本发明为双蒸发器、双增压泵和双冷凝器设计，冗余性能强，负载均衡，系统运行的安全性强，对自然冷源的使用效率高。