本发明公开了一种支架段钢箱梁全焊接高程控制方法，包括以下步骤：S1：按照安装顺序将钢箱梁依次设为第一梁段、第二梁段至第N梁段；S2：将第二梁段架设到第一梁段的安装侧，并在第二梁段的底部两端设置千斤顶，并记录顶力为P1和P2；S3：在第二梁段的底部安装支垫，卸载千斤顶并保持千斤顶卸载之后第二梁段的高程为步骤S2状态下的高程；S4：将第一梁段与第二梁段焊接固定；S5：用千斤顶顶起第二梁段，拆除支垫，并将两端千斤顶顶力调至P1和P2；S6：测量第二梁段的高程变化X；S7：在第二梁段底部安装支垫，卸载两端千斤顶后保持第二梁段的高程为S5状态下的高程；S8：按照步骤S1‑S7焊接第三梁段，且在安装第三梁段时，第三梁段根据高程变化X进行定位补偿；S9：依次安装到第N梁段。