本发明属于微生物发酵领域，特别涉及一种具有护肤功能的发酵代谢物及其制备方法与应用。该产品由植物乳杆菌、干酪乳杆菌、乳双歧杆菌、动物双歧杆菌和鼠李糖乳杆菌为发酵菌株，以蔗糖、海藻粉、大豆粉和乳粉为发酵原料，混合发酵制备获得。该产品含有丙二酰染料木苷、染料木黄酮、透明质酸、鸢尾酮、Preaustinoid A和黄豆苷元等特有发酵代谢产物有助于护肤功效的提升；发酵产生的酒石酸、苹果酸、琥珀酸、水杨酸、香草酸和苯丙酸等有机酸能够控制病原菌及腐败微生物菌群，有利于维持皮肤菌群平衡，并起到天然防腐的作用。通过功效测试，表明其具有去皱，增加皮肤弹性，抗炎症和修护皮肤屏障等功效，且效果显著。