本说明书实施例公开了一种热交换器运行监测与故障诊断方法及系统，所述方法包括采集热交换器运行状态参数数据，所述运行状态参数数据包括用于表征热交换器实时运行状态的性能参数数据；对热交换器当前运行状态进行评价，以判断热交换器当前是否处于正常运行状态；还可以构建的不受流量变化影响的故障模式判别模型，其中，所述故障模式判别模型通过对基于压降的热交换器初始故障模式判别模型进行去流量变化影响处理得到；利用所述故障模式判别模型对交换器运行状态数据进行故障模式识别，以基于识别得到的故障模式对所述热交换器进行故障诊断。可以提高热交换器故障识别与诊断的准确性与及简便性，确保热交换器机组的安全、经济运行。