本发明提供一种SOC芯片内Flash存储器的低功耗控制装置及方法，该装置包括控制逻辑模块，用于根据预先设定的控制逻辑生成时钟门控使能信号，并将其发送至时钟门控模块；还用于根据接收的控制模块反馈的操作结束信号，生成相应新的时钟门控使能信号以使时钟门控模块控制控制模块的时钟输入；时钟门控模块，用于根据标准时钟信号和时钟门控使能信号进行开启或关闭，还在开启时生成控制模块的时钟输入；控制模块，用于根据时钟输入对Flash存储器进行相应控制操作，并在操作结束后即时反馈操作结束信号至控制逻辑模块。该装置可使用NOR‑Flash直接运行程序，还能大大降低控制模块对Flash存储器进行控制操作的功耗。