本发明提供一种多主板USB服务配置方法、系统、终端及存储介质，包括：分别生成各版本USB的配置文件，并分别为每个配置文件生成唯一的表ID；将各配置文件的表ID导入中间文件；获取各主板的USB版本信息，根据各主板的USB版本适用信息从所述中间文件查找对应的表ID，并构建主板ID与表ID的映射关系；将所述映射关系导入配置管理表，所述配置管理表用于系统根据表中的映射关系为各主板调取相应的配置文件进行USB服务配置。本发明能够实现USB配置信息的快速上传，USB服务的快速配置，提高了USB配置效率，降低了研发、测试、生成和维护的成本。