本发明公开了一种基于贝叶斯算法的钻井溢流预警方法、系统和存储介质，包括以下步骤：1)根据已钻井历史数据建立数据样本；2)分类样本中的属性；3)计算溢流发生和未发生的先验概率；4)计算离散型属性和连续型属性的条件概率；5)根据贝叶斯数据挖掘算法，基于步骤3)所得先验概率、步骤4)所得的离散型属性和连续型属性的条件概率，计算溢流发生的后验概率和溢流未发生的后验概率；6)比较步骤5)中溢流发生和溢流未发生的后验概率的大小，若前者大于后者，则判断为发生溢流，否则判断为未溢流。