本发明公开了一种高精度的同步操作控制系统，包括体内电子装置和体外电子装置，其与体内电子装置无线连接；其中，当需要执行同步操作时，体外电子装置更改自身的输出电压；体内电子装置感应到输出电压发生突变后，体内电子装置和体外电子装置同时执行同步操作。本发明通过将体外电子装置的输出电压的突变作为同步信号进行传输，可以省去在电子装置内布置额外的同步信号传输的芯片，可以降低功耗，减小体内电子装置的体积布置在患者体内时，可以现实微创，减小对患者的伤害，且能够满足诱发电位检查中诱发事件和生理信号的同步精度。