本发明公开了一种水利水电工程临时生态流量管的封堵结构，修建在水工混凝土建筑物中的临时生态流量管的进水管口端为喇叭口的变径钢管，在混凝土建筑物立面设置有刀刃冲着上部的不锈钢刀框，不锈钢刀框位于变径钢管口顶上方、距变径钢管口顶一定距离，软绳下部穿过不锈钢刀框固定在混凝土建筑物上，上部固定于水面上稳定位置，封堵球组件包括一个加重橡胶球和多个封堵橡胶球，加重橡胶球球体外侧有套环，多个封堵橡胶球通过连接绳依次串接固定在套环上，封堵球组件通过套环系接并套在软绳上端。本发明充分利用管道上下游水压力差实现临时生态流量管封堵，不需要消耗额外动力，且结构简单、造价便宜、施工方便、安全性较高。