本发明公开了一种冻土区天然气水合物资源评价方法，包括以下步骤：步骤S1、收集待评价冻土区的冻土区信息并根据预设指标确定冻土区勘查级别；步骤S2、依据冻土区勘查级别确定天然气水合物资源评价指标的算法并计算出天然气水合物资源评价指标；步骤S3、将冻土区信息、天然气水合物资源评价指标推送至三维GIS实景地图作实景显示并以天然气水合物资源评价指标为导向更新所述实景显示。本发明对冻土区进行勘察分级，对不同勘察级别采用相对应的评价计算方法，并将最终的评价指标推送到由冻土区地形构建的三维GIS实景地图中进行实景显示，在能够实现大范围冻土区评价的同时还能够直观向用户展现评价结果，提高冻土区评价直观性和拓展性。