本发明公开了一种加州鲈苗种的工厂化培育系统及其实施操作方法，相邻且关联的单元养殖区形成容量定量增加的组合养殖区，同时通过旋转环的旋转及筛分器筛分间距的调节，多个筛选板组合形成多通道筛选结构、多级筛选结构的一种或者组合。本发明的有益效果为：通过第一隔板以及第二隔板的拆装，实现单元养殖区以及组合养殖区的容量定量增加，满足不同批次不同规格加州鲈苗钟的使用需求；通过移动式苗种筛选机构实现培育池和分筛池之间的筛分选育过程，通过旋转环的旋转及筛分器筛分间距的调节，多个筛选板组合形成多通道筛选结构、多级筛选结构的一种或者组合，解决了多通道以及多级多规格苗种的筛分问题。