本发明公开了一种导电聚合物及十六烷基三甲基溴化铵复合涂层的制备方法及应用，制备方法包括如下步骤：将导电聚合物单体与阳离子表面活性剂十六烷基三甲基溴化铵分散于水中得到混合溶液；于所述混合溶液中添加辅助质子酸，获得电聚合电解液；将不锈钢置于所述电聚合电解液中并通入电流，在不锈钢基体表面一步法形成导电聚合物及表面活性剂复合防腐蚀涂层。本发明提供的制备方法避免了传统涂层复杂的涂覆程序，可实现涂层在基材表面大面积地迅速、直接沉积，使涂层具有更好的隔离性质。同时，本发明的复合涂层由于十六烷基三甲基溴化铵的存在对不锈钢具有缓释作用，提高了不锈钢材料在酸性环境中的耐蚀性。