本发明公开了一种分布式新能源并网的基波和谐波电能双向计量方法，本发明包括按照指定的采样频率采集获得电压序列、电流序列；分别对电压序列、电流序列进行采样加窗和离散傅立叶变换，转换得到电压、电流的频域复数值；对原始的电压序列、电流序列以及采样加窗后所得的电压序列、电流序列分别进行离散积分获得初始电能恢复系数并进行修正；利用分组的方式对基波电能、谐波电能进行电能计量；以电能计量结果的正负判定其对应的电能传输方向，并归纳到对应的电能传输方向，得到对应电能传输方向的电能计量结果。本发明能够实现分布式新能源并网的基电能双向计量，具有计量精确度高、计算简单方便、实时性强的优点。