本发明提供了一种磁共振T2定量成像方法及系统，涉及磁共振成像领域。方法包括：设计多扫描多重叠回波T2定量成像脉冲序列并确定其采样参数；利用脉冲序列对待测样品进行多次扫描采样并对采样得到的信号进行处理得到待重建多扫描多重叠回波图像；根据待测样品特征生成设定量的训练样本；确定用于T2定量图像重建的深度神经网络并采用设定量的训练样本对该深度神经网络进行训练；将待测样品的待重建多扫描多重叠回波图像输入训练好的深度神经网络进行重建，得到待测样品的高分辨的T2定量图像。