本发明涉公开一种水生态修复装置及其修复方法，包括下端开口的导流管，导流管顶部固定有生物修复组件，导流管两侧有正离子过滤组件和负离子过滤组件；导流管内有水泵，导流管内竖直设有正电极和负电极，正电极和负电极之间设置有隔板，隔板将导流管分隔为负离子区和正离子区，正电极和负电极底部连通有絮凝剂存放箱，导流管底部外侧有感应器；正离子区与正离子过滤组件连通，负离子区与负离子过滤组件连通，正离子过滤组件和负离子过滤组件连通有汇流箱，汇流箱与生物修复组件连通；第一管路、第二管路缠绕在外侧；生物修复组件端部固定有若干浮体。本发明提供一种修复效率高且可以同时修复重金属污染和氮、磷浓度高的污染的水生态修复装置。