本发明公开了一种基于事实所有权的有效路由起源同步方法及系统，该方法包括：AS的BGP路由的路由源信息向VC服务器发起同步更新；VC服务器提取并记录满足预设观察期条件的增量路由源更新的数据发送至数据聚合管理服务器；数据聚合管理服务器对每个VC服务器发送的增量路由源更新的数据进行处理，并将处理完毕的消息发送给依赖方服务器进行汇总；依赖方服务器更新全局路由源信息表，并通过各数据聚合管理服务器转发至其连接的VC服务器中，实现数据的全局一致。本发明的方法，在不影响现有的RPKI机制的前提下，通过对有效路由源信息在采集、判定和同步等过程进行改进，以准确的判断某路由源信息是否为事实有效的。