本发明公开了一种冷冻干燥用的PCR管盖的制备方法，其制备方法包括：(1)将改性有机硅树脂加入至溶剂中，然后加入异丙醇、木质纤维素搅拌混合均匀，搅拌均匀后加溶剂调节粘度，加入硅烷偶联剂，再进行搅拌1～2h，得到耐低温材料；(2)将上述耐低温材料对PCR管盖表面进行涂覆，烘干，得到冷冻干燥用的PCR管盖。所使用的改性有机硅树脂由2‑(4‑羟基‑3‑甲氧基苯基)‑1,3‑丙二醇对有机硅树脂改性制得；本发明制得的冷冻干燥用的PCR管盖有优良耐低温性、耐酸碱腐蚀性、防潮性以及较高的透明度。