本发明公开了一种覆盖过滤器在线清洗方法，包括隔离系统、爆膜、清洗前外观检查、碱洗、漂洗、酸洗、漂洗、排液以及外观检查，利用铺膜箱，进行覆盖过滤器滤元在线清洗，既减轻了维护队伍的工作量，又保证了设备的安全性。重要的是通过在线清洗工艺，无需对过滤器的滤元进行拆卸和安装，延长了机组使用寿命。从工艺的安全角度考虑，在线清洗时过滤器为常压，凝结水是中压，即便阀门内漏，也是凝结水往精处理漏，清洗液不可能进到热力系统里，安全可靠。在线清洗所用时间短，清洗后进行漂洗，采用无死角漂洗的方法，直到漂洗液水质达到与凝结水等同的品质，清洗效果好，降低了清洗成本，解决了现有技术存在的问题。