本发明属于电力系统领域，提供了一种基于厂站的电力系统状态估计边缘服务器配置方法及系统。其中，该方法包括根据厂站地理接线图及量测配置，形成分块矩阵网络图；根据注入边最少原则对分块矩阵网络图进行厂站编号，形成有向因子图；以有向因子图为基础构造加权有向因子图；其中，点权为各厂站本地计算任务量，边权为数据传输量；由加权有向因子图为形成计算道路树，基于道路树得到所有预选分区方案，从所有预选分区方案中筛选出耗时最小分区方案作为最终的分区方案；基于最终的分区方案，对电力系统的每个分区配置一个边缘服务器，以用于当前分区内的电力系统状态并行估计。