本发明公开了一种避免直流输电系统双极闭锁的保护控制方法，包括：采集直流输电系统的换流变中性点电流以及直流侧谐波电流；根据所述换流变中性点电流判断直流输电系统是否出现互补谐振；根据直流侧谐波电流判断保护系统是否发出保护动作信号；当直流输电系统存在互补谐振且出现保护动作信号时，对最早发出保护动作信号的单极进行闭锁；监测对极的直流侧谐波电流，当对极的直流侧谐波电流满足预设的闭锁条件时，将对极进行闭锁。本发明通过监测双站四极的中性点电流，能够准确判断互补谐振，采用先跳一极的方式抑制互补谐振，能有效地避免双击闭锁。