本发明提供了一种棉田用除草剂组合物及其制剂、应用和施用方法，涉及除草剂技术领域，所述棉田用除草剂组合物包括除草剂A和除草剂B，所述除草剂A为氟啶草酮，所述除草剂B选自长链脂肪酸合成抑制剂、微管组装抑制剂、有丝分裂抑制剂、脂质合成抑制剂、光合体系IIA位点抑制剂和脂肪酸硫酯酶抑制剂中的至少一种。本发明提供的除草剂组合物制剂通过除草剂A和除草剂B相互协同增效，施用于棉田后，杂草防效高，杀草谱广，安全性好，在棉花和杂草间选择性系数明显高于单剂，增产效果明显，同时还有利于延缓单一除草剂的抗性产生，成本低，易推广。