本发明提供一种基于环境感知的机器人协同控制系统，它包括有主控中心、环境数据采集模块，主控中心下连接有多个环境数据采集模块，环境数据采集模块分别与相应的生物安全柜、封口系统、实验现场、分料系统连接；实验现场对生物缸内的样品进行实验，实验完成后通过传送带送至分料系统内，通过分料系统内的环境数据采集模块分选，再通过相应的主输出通道、次输出通道输出，输送后通过封口系统对生物罐进行封口，封口完成后进入相应的生物安全柜进行保存。本系统对完成对样本转运、样本检测、高致病性病原微生物培养以及建立实验室无人化协同作业系统有积极效果，有效解决生物安全性问题。