本发明实施例公开了一种传输系统功率谱的优化的方法、装置、电子设备及存储介质，方法包括：获取传输系统发送端以及接收端的功率谱数据集以及数字孪生模型，根据发送端以及接收端的功率谱数据集训练数字孪生模型，将训练完成后的数字孪生模型迁移至解码器，获取目标功率谱并根据目标功率谱对自编码器的编码器进行参数训练并得到训练好的编码器，根据解码器以及训练好的编码器确定训练好的自编码器，根据目标功率谱以及训练好的自编码器确定发送功率谱以使在传输系统的接收端获得目标功率谱。此外，本发明采用的自编码器的解码器结构为数字孪生模型，无需调节传输系统中的任意硬件部分，只需要调节优化发送功率谱便可实现目标功率谱，简单高效。