本发明公开了一种自隔离基片集成波导平衡式滤波功分器，包括金属地、介质基板、顶层金属层，通过连接金属层和金属地的金属化过孔形成一个全模基片集成波导方形腔构成的谐振器和两个半模基片集成波导矩形腔构成的谐振器，全模基片集成波导方形腔的一侧宽边与两个半模基片集成波导矩形腔的窄边通过感性窗相连接。还包括位于顶层的六条馈线，其中一对馈线连接全模基片集成波导方形腔连接；另外两对馈线分别连接一个半模基片集成波导矩形腔。本发明采用单层基片集成波导结构，将一个公共的全模基片集成波导腔与两个半模基片集成波导腔相结合，形成一个同时具有小尺寸、自隔离及结构简单特点的基片集成波导平衡式滤波功分器。